王政文*（2024.02）。歷史人物的書寫與形象塑造：論李友邦的三種英雄形象。東海歷史研究集刊，（5），167-217。
期刊論文
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王政文*（2023.12）。新店教會的設立與初代信徒。白沙歷史地理學報，（22），43-68。
王政文*（2022.12）。馬偕的博物志：論偕叡理牧師（George Leslie MacKay）的收藏。臺北文獻，（222），137-185。
(王政文)* (2022.12). 一九世紀における台湾キリスト教徒の社会像および社会地位. キリスト教文化, (20), 48-77.
王政文*（2022.06）。第四屆歷史上的民眾與社會：臺灣史與社會網絡學術研討會暨林本源中華文化教育基金會年會會議紀要。臺灣風物，72（2），221-228。
(王政文)*（2021.09）。在日臺灣基督徒與1920年代社會運動。台灣學通訊，（123），28-29。
(王政文)*（2020.12）。學術動態：「東亞脈絡中的台灣基督教史」國際學術研討會。漢語基督教學術論評，0（28），192-194。
王政文*（2020.12）。清末屏東地區族群社會網絡與基督徒群體的形成。白沙歷史地理學報，（21），1-30。
王政文*（2020.12）。東海大學董事會的組成及其人事結構分析（1953-1971）。東海歷史研究集刊，（4），41-76。
王政文*（2019.09）。「校史、會堂史、機構史的編撰與書寫」學術研討會會議紀要。基督教與華人文化社會研究中心通訊，0（14），12-12。
王政文*（2018.03）。台灣基督徒史資料庫與社會網絡研究。台灣學通訊，0（104），22-23。
王政文（2017.03）。清末噶瑪蘭基督徒與漢番社會網絡。民俗曲藝，0（195），141-206。
王政文*（2016.09）。「台灣基督徒史」的重要性及其研究方法。基督教與華人文化社會研究中心通訊，0（8），9-12。
王政文（2016.03）。近代臺灣基督徒的婚姻網絡：以滬尾、五股坑教會信徒為例。新史學，27（1），175-246。
王政文（2015.09）。重現與重建：論「台灣基督徒史」的建構與書寫方法。東海歷史研究集刊，2，257-300。
王政文（2015.08）。麥仔落土：三重埔、錫口、水返腳的初代基督徒家族及其婚姻網絡。歷史와實學，57，261-308。
王政文（2014.09）。古文書所見清代沙轆社土地流失原因析探。興大人文學報，0（53），121-144。
王政文（2014.06）。無語問上帝：十九世紀台灣基督徒的社會處境。漢語基督教學術論評，0（17），111-148。
王政文（2013.12）。十九世紀台灣基督徒的社會形象與地位。海洋文化學刊，15，41-74。
王政文（2013.09）。「宗教中的教徒：第二屆歷史上的民眾與社會」學術研討會紀要。東海歷史研究集刊，1，229-238。
王政文（2013.02）。十九世紀來台傳教士的海洋經驗與書寫。耽邏文化，42，7-38。
王政文（2012.12）。改宗所引起的家庭與人際衝突：以十九世紀台灣基督徒為例。台灣文獻，63（4），3-32。
王政文（2012.12）。19世紀台灣キリスト教徒のアイデンティティ。高知大國文，（43），87-103。
王政文（2010.12）。是誰選擇誰：十九世紀來台傳教士與信徒改宗的社會脈絡。基督教與中國社會文化：第四屆國際年青學者研討會論文集，，451-475。
王政文（2010.05）。彰化平原「福佬客」的形成與變遷。地方史與地方文化（韓文期刊）（Journal of Local History and Culture），13（1），307-324。
王政文（2009.12）。改宗與日常：十九世紀台灣第一代基督徒的日常生活。台灣文學的大河：歷史、土地與新文化—第六屆台灣文化國際學術研討會論文集，，202-248。
王政文（2007.12）。創造的「歷史與文化」：論布農族武界部落的歷史發展與建構。歷史教育，（11），205-228。
王政文（2007.06）。政治宣傳與醫務生產：論台灣義勇隊的組織與活動。史耘，（12），87-110。
王政文（2005.06）。「武界」部落的形成及其地名由來的幾種說法。台灣文獻別冊，（13），49-56。
王政文（2003.05）。台灣籍民在大陸地區之處境—以台灣義勇隊為中心的論述。台灣歷史學會會訊，（16），31-42。
研討會論文
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王政文* (2024.06). The Research Process of George Leslie MacKay and the Rediscovery of Historical Materials. Paper presented at The 13th International Symposium on the History of Christianity in Modern China, 香港：香港浸會大學: 香港浸會大學基督教研究中心、香港中文大學崇基學院合辦.
王政文*（2023.08）。新店教會的設立與初代信徒。論文發表於磐石的信仰 恩典的足跡：新店教會史研討會，台北：國立政治大學臺灣史研究所、臺灣基督長老教會新店教會主辦。
王政文*、范純武（2022.12）。民俗與宗教史的研究回顧與展望。論文發表於2020至2021臺灣史研究的回顧與展望學術研討會，台南：國立臺灣歷史博物館：國立臺灣歷史博物館、國立臺灣師範大學臺灣史研究所、國立政治大學臺灣史研究所、中央研究院臺灣史研究所主辦。
王政文*（2022.11）。馬偕（George Leslie MacKay）的臨終紀錄與死亡書寫。論文發表於「形塑傳記：歷史性與日常性」國際學術研討會，台北：中央研究院近代史研究所：中央研究院近代史研究所主辦。
王政文*（2022.10）。馬偕的書單：論偕叡理牧師（George Leslie MacKay）的閱讀與日常生活。論文發表於「當世賢者─宗教典範人物」學術研討會暨台灣宗教學會2022年年會，台北：真理大學：台灣宗教學會主辦。
(王政文)*（2021.11）。近代台灣基督徒家族的婚姻與社會網絡—兼論歷史學「網絡」研究的發展與侷限。論文發表於第四屆歷史上的民眾與社會：台灣史與社會網絡學術研討會暨林本源中華文化教育基金會年會，台中：東海大學歷史學系、林本源中華文化教育基金會。
(王政文)*（2021.11）。馬雅各的助手及其宣教網絡。論文發表於湯姆生、馬雅各與臺灣多元族群文化路徑研討會，台南：國立臺灣歷史博物館主辦。
王政文*（2021.08）。馬偕的博物志：論偕叡理牧師（George Leslie MacKay）的收藏與嗜好。論文發表於第十二屆近代中國基督教史國際研討會，香港：香港浸會大學歷史系、建道神學院基督教與中國文化研究中心合辦。
王政文*（2020.11）。日治時期東京台灣基督徒的政治參與。論文發表於「角力、並存還是共生：宗教與政治的今昔」天主教輔仁大學宗教學系年度研討會，天主教輔仁大學：天主教輔仁大學宗教學系。
王政文*（2020.11）。清末屏東地區族群社會網絡與基督徒群體的形成。論文發表於土地、語言與時間：台灣原住民民族學術研討會，國立高雄師範大學：國立高雄師範大學台灣歷史文化及語言研究所主辦。
王政文*（2020.11）。馬偕的病歷：《馬偕日記》中的疾病與日常生活。論文發表於第八屆日記研討會：日記中的歷史事件，國立彰化師範大學歷史學研究所主辦：中央研究院台灣史研究所、國立彰化師範大學歷史學研究所。
王政文*（2019.11）。東亞基督徒的社群網絡：以東京台灣基督徒為中心的探索。論文發表於第十三屆「現代中國與東亞新格局」國際研討會，花蓮：大阪大學中國文化論壇、天津南開大學歷史學院、東華大學歷史學系。
(王政文)*（2019.10）。東海大學成立初期的人事結構（1952-1971）。論文發表於「回顧與展望：中國教會大學史研究三十年」國際學術研討會，武漢：華中師範大學東西方文化交流研究中心、華中師範大學中國近代史研究所主辦。
王政文*（2019.03）。東亞基督徒的流動與交往：日治時期台灣基督徒在東京的活動。論文發表於東亞脈絡中的台灣基督教史學術研討會，台南：台南神學院：東アジアキリスト教交流史研究会主辦。
(王政文)*（2018.12）。清末下淡水溪平原漢番社會與基督宗教信仰。論文發表於「帝國、邊區與流動：18、19世紀台灣沿山社會秩序」國際學術研討會，南投：國立暨南國際大學歷史學系：中央研究院台灣史研究所、國立暨南國際大學歷史學系主辦。
王政文*（2018.10）。「抗日」的過去式與現在式：「紀念」台灣義勇隊的歷史反思。論文發表於「趙明河義士殉國九十週忌—韓國獨立運動暨台灣」國際學術研討會，台北：國立政治大學：大韓民國獨立紀念館、國立政治大學韓文系主辦。
(王政文)*（2018.03）。日本統治下的台灣基督徒網絡—以「東京台灣教會」的創立為討論中心。論文發表於「日本帝國下的基督教會」國際學術研討會，桃園：國立中央大學：國立中央大學人文研究中心、輔仁大學天主教史研究中心主辦。
王政文*（2017.02）。清代下淡水溪平原漢番社會與基督宗教信仰。論文發表於帝國邊緣與流動：清代下淡水溪平原暨山腳、恆春半島社會秩序工作坊，台北：中央研究院台灣史研究所：中央研究院台灣史研究所。
王政文*（2016.11）。基督徒家族、婚姻與社會網路的研究取徑與方法—以清末台灣下淡水溪平原為例。論文發表於近代中國的家族制度與家庭觀念：第六屆中國近代思想史暨嶽麓書院創立1040周年國際學術研討會，長沙：中國社會科學院中國近代思想研究中心、湖南大學嶽麓書院合辦。
(王政文)*（2016.11）。基督徒史研究的再思。論文發表於中國處境中的宗教研究與宗教對話」學術會議，汕頭：汕頭大學文學院基督教研究中心、福建師範大學中國基督教研究中心、中原大學基督教與華人文化社會研究中心合辦，。
王政文（2015.11）。清末噶瑪蘭基督徒與漢番社會網絡。論文發表於第四屆「族群、歷史與地域社會」學術研討會，台北：中央研究院台灣史研究所。
王政文（2015.10）。戰爭中的台灣基督教徒（1865-1895）。論文發表於2015年戰爭與和平國際學術研討會：宗教視角，香港：建道神學院。
王政文（2015.10）。「台灣與抗戰」的歷史書寫：從李友邦的英雄形象談起。論文發表於台灣與抗戰學術研討會，南投：國史館臺灣文獻館。
王政文 (2015.08). 제2차 대전 중 동아시아의 항일활동-대만의용대와 조선의용대를 중심으로-. Paper presented at 광복70주년 및 개관28주년 기념 국제학술심포지엄：동아시아에서 항일투쟁의 전개와 역사적 위상, 서울（首爾）: 독립기념관한국독립운동사연 구소.
王政文*（2015.06）。清末八里坌地區基督教徒的婚姻網絡。論文發表於第六屆區域史地暨應用史學學術研討會，嘉義：國立嘉義大學應用歷史學系。
王政文*（2015.06）。十三所基督教大學在台灣的延續與斷裂：論東海大學創立初期的幾個問題。論文發表於第九屆近代中國基督教史國際研討會，香港：香港浸會大學歷史系、近代史研究中心、建道神學院基督教與中國文化研究中心。
王政文（2015.02）。屏東地區基督徒群體的形成及其社會網絡（1865-1900）研究芻議。論文發表於「邊區台灣」研究：大武山兩側及恆春半島之人群、經濟活動與社會秩序，屏東：中央研究院台灣史研究所。
王政文（2014.10）。清末台灣北部基督教徒的婚姻網絡：以滬尾、五股坑教會為例。論文發表於2014第六屆台北學：台北建城130週年紀念學術研討會，台北：台北市文化局。
王政文（2014.10）。二戰期間在福建的台灣人。論文發表於第二屆兩岸文化發展研討會，福州：福建師範大學。
Cheng-wen Wang(王政文)* (2014.07). Family and Interpersonal Conflicts: Early Protestant Converts in Taiwan (1865-1895). Paper presented at Association for Asian Studies (AAS-in-Asia) Conference 2014, National University of Singapore (NUS), Singapore: Association for Asian Studies (AAS).
王政文（2014.06）。被忽略的傳播者：台灣基督徒在基督教傳播中的角色（1865-1895）。論文發表於近現代海域亞洲的新媒介與宗教，台北：世新大學舍我紀念館。
王政文（2013.10）。邊緣成中心：清末基督教在台的漢番宣教策略。論文發表於中西交匯中的近代中國都市與鄉村國際學術研討會，杭州：中國社會科學院近代史研究所、杭州師範大學歷史系、香港中文大學崇基學院宗教與中國社會研究中心。
王政文（2013.06）。「基督徒史」的書寫方法與可能性—論台灣基督徒史資料庫之建立與運用（1865-1895）。論文發表於第八屆近代中國基督教史國際研討會，香港：香港浸會大學。
王政文（2013.05）。從契約文書看清代沙轆社的土地流失問題。論文發表於第七屆臺灣古文書與歷史研究學術研討會，台中：逢甲大學歷史與文物研究所。
王政文 (2012.09). 十九世紀來台傳教士的海洋經驗與書寫. Paper presented at 耽邏大典國際學術研討會, 韓國濟州: 國立濟州大學耽邏文化研究所主辦.
王政文（2012.06）。改宗所引起的家庭與人際衝突：以十九世紀台灣基督徒為例。論文發表於宗教中的教徒—第二屆歷史上的民眾與社會學術研討會，台中：東海大學歷史學系主辦。
王政文（2011.12）。十九世紀台灣基督徒研究與史料探討。論文發表於台灣教會史料國際學術研討會，桃園：國立中央大學歷史研究所、中原大學通識教育中心、台灣基督教史學會。
王政文（2011.05）。無語問上帝：十九世紀台灣基督徒的社會處境。論文發表於歷史上的民眾與社會國際學術研討會，台中：東海大學歷史學系主辦。
王政文（2010.10）。現代化與基督徒身份的交結：論十九世紀台灣基督徒的自我認同。論文發表於現代化視野下的教會和社會國際學術研討會，桃園：中原大學宗教研究所、洛杉磯基督教與中國研究中心合辦。
王政文（2010.04）。聖徒與歹徒：文本著述中的台灣基督徒形象（1865-1895）。論文發表於文本解讀與經典詮釋—基督教文學學術研討會，桃園：中原大學通識教育中心、台灣基督教史學會、中央大學歷史學研究所主辦。
王政文（2009.09）。改宗與日常：十九世紀台灣第一代基督徒的日常生活。論文發表於第六屆台灣文化國際學術研討會—台灣文學的大河：歷史、土地與新文化，台北、台南：國立台灣師範大學台灣文化及語言文學研究所、長榮大學台灣研究所主辦。
王政文（2008.12）。是誰選擇誰：十九世紀來台傳教士與信徒改宗的社會脈絡。論文發表於第四屆「基督教與中國社會文化」國際年青學者研討會，香港：香港中文大學崇基學院宗教與中國社會研究中心、美國舊金山大學利瑪竇中西歷史文化研究所合辦。
王政文（2007.11）。消失的客家人：彰化平原「福佬客」的形成與變遷。論文發表於第七屆「客家研究」研究生學術論文研討會，桃園：國立中央大學客家社會文化研究所主辦。
王政文（2005.10）。當代政治與歷史想像：論台灣抗日運動中的「台灣派」與「祖國派」。論文發表於抗戰勝利與台灣光復六十週年紀念學術討論會，台北：中國國民黨文化傳播委員會黨史館、中正文教基金會主辦。
王政文（2005.09）。謝南光、李友邦、張邦傑：台灣革命同盟會內部的人事關係。論文發表於第六屆兩岸三地歷史學研究生論文發表會，北京：北京大學、政治大學、珠海書院合辦。
王政文（2005.08）。間接射擊：論抗戰時期台灣義勇隊的成立。論文發表於紀念抗戰勝利六十週年學術研討會，台北：國防部史政編譯室主辦。
王政文（2004.12）。創造的「歷史與文化」：論布農族武界部落的歷史發展與建構。論文發表於疆界／將屆2004年文化研究研討會，新竹：交通大學社會與文化研究所、文化研究學會合辦。
王政文（2004.09）。論國民政府與台灣義勇隊之關係（1937-1945）。論文發表於第五屆兩岸三地歷史學研究生論文發表會，南京：南京大學、政治大學、珠海書院合辦。
專書
王政文*（2019.04）。天路歷程：清末台灣基督徒的改宗與認同。臺北：國立臺灣大學出版中心。（ISBN：9789863503408）
（2011.10）。台灣義勇隊：台灣抗日團體在大陸的活動（1937-1945）。台北：五南文化事業台灣書房出版公司。（ISBN：9789866318122）
專書部份章節
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王政文*（2023.03）。導讀：二十世紀中國天主教與樂勒脫修女會。載於張曉蕊（主編），一段未知的旅程：從江淮水災到共產中國-樂勒脫修女眼中的動盪年代（6-9頁）。台北：臺灣商務印書館。（ISBN：9789570534761）
王政文*（2022.12）。臨終歲月：馬偕的疾病與死亡。載於鄭仰恩、曾宗盛（主編），論述與傳承：紀念馬偕來台宣教150周年論文集（151-168頁）。台北：橄欖出版有限公司。（ISBN：9789575569471）
王政文*（2022.12）。萬榮華與宣教百年史。載於劉維瑛（主編），傳揚祂旨意：英格蘭長老教會宣教史1847-1947（13-31頁）。台南：國立台灣歷史博物館。（ISBN：9789865327811）
王政文*（2021.06）。清代臺灣，在祖先和上帝間選邊站的基督徒們。載於賴真真（主編），台灣史上的小人物大有事（246-255頁）。台北：圓神出版社。（ISBN：9789861337685）
王政文*（2018.12）。評論「改宗信主的噶瑪蘭人—馬偕洗禮簿宜蘭信徒資料探討」。載於李素月（主編），宜蘭的宗教與信仰：「宜蘭研究」第十二屆學術研討會論文集（209-212頁）。宜蘭：宜蘭縣史館。（ISBN：9789860583519）
(王政文)*（2017.11）。近代台灣基督徒人際網絡的研究方法與實務。載於林香伶（主編），論文寫作不藏私:文史哲教授通通告訴你（193-216頁）。台北：五南出版社。（ISBN：9789571194394）
王政文*（2017.06）。十三所基督教大學在台灣的延續與斷裂—論東海大學創立初期的幾個問題。載於黃文江、張雲開、陳智衡（主編），恆與變之間：1949年以來的中國基督教史論集（321-350頁）。香港：建道神學院。（ISBN：9789881421050）
王政文*（2017.06）。王成勉教授對中國基督教史研究的貢獻。載於黃文江、張雲開、陳智衡（主編），恆與變之間：1949年以來的中國基督教史論集（565-572頁）。香港：建道神學院。（ISBN：9789881421050）
王政文*（2015.11）。東海前史：聯董會與十三所基督教大學。載於東海大學校史編輯委員會編（主編），東海大學六十年校史1955-2015（8-23頁）。台中：東海大學。（ISBN：9789865990824）
王政文（2015.10）。近代八里坌教會的基督徒家族及其婚姻網絡。載於吳昆財（主編），第六屆區域史地暨應用史學學術研討會論文集（217-244頁）。嘉義：國立嘉義大學應用歷史學系。（ISBN：9789860466232）
王政文（2015.08）。邊緣成中心：清末基督教在台的漢番宣教策略。載於趙曉陽、周東華、劉忠明（主編），中西交匯中的近代中國都市和鄉村（259-278頁）。北京：社會科學文獻出版社。（ISBN：9787509778265）
(王政文)*（2015.07）。戰爭結束前後的台灣。載於呂芳上（主編），中國抗日戰爭史新編 陸 戰後中國（393-425頁）。台北：國史館。（ISBN：9789860449389）
王政文*（2015.06）。「基督徒史」的書寫方法與可能性—論台灣基督徒史及基督徒人際網絡資料庫之建立與運用。載於黃文江、張雲開、陳智衡（主編），變局下的西潮：基督教與中國的現代性（653-670頁）。香港：建道神學院。（ISBN：9789889975050）
王政文（2013.12）。十九世紀台灣基督徒研究與史料探討。載於王成勉（主編），台灣教會史料論集（17-36頁）。台北：遠流出版社。（ISBN：9789860391718）
（2011.10）。現代化與基督徒身份的交結：論十九世紀台灣基督徒的自我認同。載於李靈、曾慶豹（主編），中國現代化視野下的教會與社會（261-274頁）。上海：上海人民出版社。（ISBN：9787208102149）
（2010.12）。是誰選擇誰：十九世紀來台傳教士與信徒改宗的社會脈絡。載於劉忠明、吳小新（主編），基督教與中國社會文化：第四屆國際年青學者研討會論文集（451-475頁）。香港：香港中文大學崇基學院宗教與中國社會研究中心。（ISBN：978-988-99153-5-3）
（2009.12）。改宗與日常：十九世紀台灣第一代基督徒的日常生活。載於李勤岸、陳龍廷（主編），台灣文學的大河：歷史、土地與新文化—第六屆台灣文化國際學術研討會論文集（202-248頁）。高雄：春暉出版社。（ISBN：986632710-8）
（2006.06）。間接射擊：論抗戰時期台灣義勇隊的成立。載於李君山等編著（主編），榮耀的詩篇：紀念抗戰勝利六十週年學術論文集（235-258頁）。台北：國防部史政編譯室。（ISBN：986-00-5484-3）
（2006.06）。謝南光、李友邦、張邦傑：台灣革命同盟會內部的人事關係。載於胡春惠、彭明輝（主編），近代中國與世界的變遷（1-18頁）。台北：國立政治大學歷史學系。（ISBN：986-00-4634-4）
（2005.06）。論國民政府與台灣義勇隊之關係（1937-1945）。載於胡春惠、薛化元（主編），中國知識分子與近代社會變遷（163-178頁）。台北：國立政治大學歷史學系。（ISBN：986-00-1112-5）
策劃工作
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王政文*（2021.11）。策劃第四屆歷史上的民眾與社會：臺灣史與社會網絡國際學術研討會暨林本源中華文化教育基金會年會。東海大學歷史學系、林本源中華文化教育基金會。
王政文*（2021.04）。策劃2021年第十一屆東海大學文史哲三系研究生論文聯合發表會。東海大學歷史學系。
王政文*（2020.12）。策劃HAI大眾史學工作坊。東海大學歷史學系。
王政文*（2020.09）。策劃「2020年基督教宣教士文史」國際學術研討會。東海大學歷史學系、彰基文史博物館、英國中央蘭開夏大學亞太學院、國立中興大學歷史學系、台灣基督長老教會主辦。
王政文*（2019.12）。策劃性別史精進班成果發表工作坊。東海大學歷史學系、中央研究院近代史研究所。
王政文*（2018.12）。策劃「校史、會堂史、機構史的編撰與書寫」學術研討會。東海大學歷史學系、台灣基督教史學會。
王政文（2014.03）。策劃典範的建構—東海校史暨人物傳記書寫工作坊。中區區域教學資源中心、東海大學中區中文寫作中心、東海大學歷史學系。
王政文（2013.12）。策劃第十一屆歷史學研究生論文發表會。中國歷史學會、東海大學歷史學系。
王政文（2012.06）。策劃宗教中的教徒—第二屆歷史上的民眾與社會學術研討會。東海大學歷史學系。
許文雄、王政文、陳計堯、翁育瑄（2011.05）。策劃歷史上的民眾與社會國際學術研討會。東海大學歷史學系。
王成勉、李宜涯、王政文（2010.04）。策劃文本解讀與經典詮釋—基督教文學學術研討會。台灣基督教史學會、中原大學通識教育中心、中央大學歷史學研究所。