陳建仁*、北村亘 (2023.12). 日本との比較で学ぶ台湾入門（2）台湾の総統の役割. 台湾情報誌「交流」, (993), 8-15.
期刊論文
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陳建仁、北村亘 (2023.09). 日本との比較で学ぶ台湾入門（１）：台湾の民主主義への関心のたかまり. 台湾情報誌「交流」, (990), 7-12.
陳建仁、黃信達*、王士胤（2023.03）。專業或忠誠？民主治理下的地方一級機關首長任用條件分析。臺灣民主季刊，20（1），1-56。
陳建仁, 李文堂（2016.12）。日本加入跨太平洋夥伴關係協議政策發展之分析。問題與研究，55（4），57-86。
陳建仁*（2016.03）。走出決策舒適圈：行政組織決策過程的異議文化形成與人才培養。研習論壇，183，33-39。
陳建仁（2012.07）。全球化時代的分權型地方治理機制初探。研習論壇，（139），46-53。
陳建仁,周柏？（2012.06）。都市內分權與環境治理機制：以台中市大雪山社區為例。臺灣民主季刊，9（2），125-165。
陳建仁（2011.09）。日本廣域行政的地方立法機關角色之探討。問題與研究，50（3），49-74。
陳建仁（2010.10）。地方治理中的政治參與途徑初探。中國地方自治雜誌，63（10），31-41。
陳建仁（2010.06）。從單一國到聯邦國？──日本廣域自治體合併的構想與爭議之初探。中華行政學報，（7），185-196。
陳建仁,陳宏杰（2010.06）。台灣地方立法機關之行政監督權初探。中華行政學報，（7），197-207。
陳建仁（2008.12）。單一制國家中央與地方夥伴關係之建構──以日本地方分權改革為例。東吳政治學報，26（4），97-143。
陳建仁、曾英宏（2008.10）。英國布萊爾政府地方分權改革之探討：以中央與地方關係再構築為核心。中國地方自治雜誌，61（10），42-52。
陳建仁（2008.06）。精省與區域發展。中國地方自治雜誌，61（6），42-52。
研討會論文
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陳建仁*（2014.09）。日本基層自治體合併課題初探。論文發表於2014縣市合併改制暨兩岸都會治理學術研討會，東海大學社科院SS524會議室：東海大學、南開大學。
陳建仁*（2013.12）。預防難以預防的災害：311 震災後的東京都會區減 災體制與廣域對應之初探。論文發表於城市發展與復原治理，高雄市蓮潭會館：義守大學公共政策與管理學系主辦。
(陳建仁)*（2013.05）。直轄市區自治之研究。論文發表於府際關係研究中心「直轄市區自治之研究」圓桌論壇，暨南國際大學公共行政與政策學系：暨南國際大學公共行政與政策學系。
陳建仁、林芳吟（2013.05）。基礎自治體之區域化：台灣鄉鎮市行政規模之困境與對策初探。論文發表於第八屆全球化與行政治理國際學術研討會，開南大學：開南大學公管系。
陳建仁*（2013.03）。編制5大都市及行政院直轄市化之企圖與現狀。論文發表於2013年日本法政學會年會，國立政治大學國際關係研究中心國際會議廳：日本法政學會、國立政治大學國際關係研究中心。
專書
陳建仁*（2018.05）。合作或合併：日本跨域治理機制的變遷。：雙葉書廊。（ISBN：9789579096119）
（2010.10）。從中央支配到地方自主：日本地方分權改革的軌跡與省思。台北：Airiti Press。（ISBN：978-986-6286-32-2）
專書部份章節
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陳建仁*、李文堂、林子立（2018.08）。制度治理：台中市議員初選提名的機制與變遷。載於紀俊臣、邱榮舉（主編），地方治理的問題與對策：理論與實務分析（349-370頁）。：致知學術出版社。（ISBN：9789865681869）
(陳建仁)*（2016.09）。從環境治理到低碳社會：日本環境示範都市之機制與課題初探。載於周桂田（主編），永續與綠色治理新論（187-216頁）。台灣台北：韋伯文化。（ISBN：978-986-427-086-6）
陳建仁*（2016.01）。日本環境治理法治與夥伴關係之發展。載於宋興洲（主編），永續發展環境治理的個案分析（237-272頁）。：東海大學。（ISBN：978-986-345-204-1）
陳建仁*（2015.11）。東亞的官治與自治文化：台灣與日本的地方府會關係之比較。載於謝政諭,高橋伸夫（主編），新世紀東亞的秩序與和平（412-423頁）。：前衛出版社。（ISBN：978-957-801-783-2）
陳建仁*（2014.06）。全球化時代的分權型地方治理機制之初探。載於周均育（主編），研習論壇精選 第七輯-變動與創新時代中新治理的理路：協力治理、複合治理、地方治理、關係治理、性別治理、創新治理（183-196頁）。：行政院人事行政總處地方行政研習中心。（ISBN：978-986-04-1822-4）
（2010.06）。從第一波民主化國家發展審視地方自治對民主穩定之影響。載於宋興洲、陳建仁（主編），公共政策與地方治理──地方自治論文集（313-324頁）。：Airiti Press與東海大學政治系。
（2010.05）。日本行政改革過程中電子化地方自治體的作用──以擴大參與及深化民主為焦點。載於姜新立、張錦隆（主編），【政治與資訊的交鋒】（151-171頁）。：揚智。