潘兆民*（2025.08）。兩岸關係、貿易戰與台灣風險。理論與政策，28（2），119-126。
期刊論文
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潘兆民*（2023.08）。中美競合下的兩岸關係：以美國拜登政府定義下的中國挑戰談起。理論與政策，26（2），49-63。
(潘兆民)*（2021.04）。疫情後的中國大陸內政與外交政策：自信與挑戰。歐亞研究，1（15），61-70。
潘兆民*（2020.03）。防疫:兩岸需要同理心。海峽評論，0（351），39-43。
潘兆民*（2019.12）。評析「一國兩制台灣方案」的爭辯。亞洲政經與和平研究，0（2），17-23。
潘兆民*（2018.11）。中國大陸對臺青年「融合發展」策略與挑戰。展望與探索，16（11），33-41。
潘兆民*（2018.09）。走出兩岸困境的「中道」思維：和平發展的制度化。中華戰略學刊，107（3），244-272。
潘兆民*（2017.12）。探索中國大陸國家高端智庫。展望與探索，15（12），32-40。
潘兆民*（2017.08）。當前兩岸命運共同體的價值爭辯:合作對抗模式的建構。台灣研究，0（146），9-18。
潘兆民*（2017.06）。兩岸區域和平發展策略的新思維:政策學習的分析途徑。中華戰略學刊，106（2），1-26。
潘兆民*（2017.05）。大陸發布《網絡空間國際合作戰略》政策意涵之評析。展望與探索，15（5），30-37。
張寶蓉、潘兆民（2016.07）。兩岸高等教育交流合作的歷史發展、現狀與前瞻。朝陽學報，0（21），17-33。
潘兆民*（2016.05）。兩岸關係和平發展的「中道」思維。中共研究，50（3），81-87。
潘兆民*（2016.01）。“一帶一路”兩岸共建永續發展的切入點。台聲，0（372），41-41。
潘兆民*（2015.11）。東海大學的通識與博雅教育。臺灣教育評論月刊，4（11），136-140。
潘兆民*（2015.07）。兩岸關係2.0的新思維：台灣主要政黨之兩岸政策展望。全球政治評論，0（51），35-42。
潘兆民*（2015.06）。中國區域發展與地方治理的再認識: 局部改革的政治濟學分析。復旦政治學評論第十四輯(保護社會的政治)，14輯，96-118。
潘兆民（2015.01）。中國大陸查處商業賄賂情勢之研析。展望與探索，13（1），27-32。
潘兆民（2014.09）。孫文學說與中國大陸的區域發展:不平衡發展下的轉型困境。宗教哲學，0（69），31-65。
潘兆民、張植榮（2014.01）。兩岸互信建設需要新思維。中國評論，0（193），25-29。
潘兆民（2013.12）。中國大陸漸進改革的再認識。國際政治與經濟論叢，0（1），21-50。
潘兆民（2013.03）。中國十八大後對區域安全之影響。全球政治評論，41，13-18。
潘兆民（2012.03）。中國大陸發表《中國的和平發展》白皮書的戰略分析。2011年展望與探索月刊時評文集，9（10），182-192。
潘兆民 廖婉君（2011.10）。中國二元發展模式的反思---勞動力轉移的「缺工潮」解釋。遠景基金會季刊，12（4），157-205。
潘兆民（2010.12）。中國鄉鎮人大制度重構的路徑分析---利益表達機制的困境。中國大陸研究，53（4），38-67。
潘兆民（2009.07）。中國地方人大的治理能力分析-國家能力的檢視。東亞研究，，65-97。
潘兆民（2008.09）。中國大陸基層民主與鄉鎮人大代表的角色重構。陳明明主編《復旦政治學評論》，0（6），34-51。
潘兆民*（2007.11）。中國地方人大的身分結構變遷及其影響分析--地方政治菁英的壟斷行為=An Impact Analysis on the Changing Status Structure of the Chinese Local People's Congress: The Monopoly of Local Political Elites。展望與探索，5-11，22-38。
潘兆民*（2005.04）。中國基層民主「鄉政」與「村治」緊張關係的後社會主義分析。展望與探索，3:4，46-57。
潘兆民（2004.11）。中國大陸「鄉政」對「村治」運作的影響分析。廣州中山大學行政管理研究中心，11，42-58。
潘兆民*（1997.07）。兩岸關係的回顧與大陸政策的前瞻。台研兩岸前瞻探索，1（4），83-95。
潘兆民*（1993.07）。後毛時期的中共政治改革的情境分析和政策分析。國立台北護專學報，1（10），285-311。
潘兆民*（1992.06）。馬克思人性觀的再認識。國立臺北護專學報，1（9），341-351。
潘兆民*（1988.10）。中共社會主義初級階段論的剖析。東亞季刊，20（2），45-66。
研討會論文
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潘兆民*（2019.07）。兩岸融合發展的挑戰:中美競合下的影響分析。論文發表於第二十八屆兩岸關係學術研討會，廣西南寧：全國台灣研究會、中國社會科學院台灣研究所。
潘兆民*（2018.07）。兩岸融合發展的價值競合:什麼因素影響台灣青年的政治認同。論文發表於第二十七屆兩岸關係學術研討會，山東青島：全國台灣研究會、中國社會科學院台灣研究所。
潘兆民*（2017.11）。兩岸交流三十年的變與常：以兩岸融合的建構為例。論文發表於兩岸交流三十年學術硏討會，厦門市：厦門大學。
潘兆民*（2016.11）。兩岸命運共同體的價值形塑。論文發表於第二屆中華文化論壇，北京大學：北京大學。
潘兆民*（2016.07）。兩岸關係和平發展的中道思維。論文發表於第二十五屆兩岸關係學術研討會，四川成都：全國台灣研究會、中國社會科學院台灣研究所。
潘兆民*（2015.06）。通識與博雅教育在台灣:以東海大學為例。論文發表於兩岸課程與教科書發展的回顧與前瞻學術研討會，中國大陸泉州：厦門大學。
潘兆民*（2015.05）。兩岸關係2.0新思維:台灣主要政黨之兩岸政策展望。論文發表於第九屆兩岸和平論壇，中興大學：中興大學國際政治研究所。
潘兆民*（2015.04）。兩岸關係2.0的新思維:中間理論的分析途徑。論文發表於兩岸關係和平發展回顧與展望研討會，南京市：南京大學。
潘兆民*（2014.09）。新時期兩岸互信機制建構與新思維:建構合作安全情境。論文發表於第五屆台灣研究新跨越學術研討會，厦門大學：厦門大學台灣研究院。
潘兆民（2013.10）。中國大陸的區域發展與孫文學說。論文發表於2013孫文論壇，中興大學：中興大學國際政治研究所、中國社會科學近代史研究所。
潘兆民*（2012.12）。台灣政黨競爭關係分析。論文發表於香港政黨關係學術研討會，上海復旦大學港台行政研究中心：上海復旦大學港台行政研究中心舉辦。
潘兆民*（2011.12）。香港與台灣政黨發展的比較。論文發表於香港政黨歷史-社會-文化學術研討會，上海復旦大學港台行政研究中心：上海復旦大學港台行政研究中心舉辦。
潘兆民（2011.11）。建構兩岸互信的新思維。論文發表於2012年兩岸情勢的挑戰與機會：經略兩岸、前瞻國防，東海大學：東海大學中國政治學會。
潘兆民（2011.10）。中國區域發展的策略分析。論文發表於百年民國－自由民主與兩岸和平之際遇（2011年中國政治學會年會暨學術研討會），東海大學：中國政治學會。
潘兆民（2011.03）。中國區域經濟發展策略分析─從缺工潮解釋。論文發表於2011第五屆轉型與治理學術研討會，台北：銘傳大學公共事務學系。
潘兆民（2010.06）。中國模式下地方人大治理的困境分析。論文發表於新區劃、新思維2010年地方自治新局的開創與展望學術研討會，東海大學：東海大學政治學系。
潘兆民（2010.01）。中國大陸鄉鎮人大的制度變遷與困境。論文發表於兩岸三地地方制度與治理學術研討會，東海大學：東海大學都市計劃暨區域發展研究中心。
潘兆民（2010.01）。中國鄉鎮人大重構的路徑分析。論文發表於中國地方自治的歷史與理論學術研討會，上海復旦大學：上海復旦大學中國政府與政治研究中心。
潘兆民（2008.07）。地方人大治理能力分析。論文發表於共和國制度成長的政治基礎研討會，上海復旦大學：上海復旦大學中國政府與政治研究中心。
潘兆民（2007.07）。地方人大代表的結構變遷對其監督效益的影響分析。論文發表於中國民主政治的發展路徑：選舉與協商研討會，上海復旦大學：上海復旦大學中國政府與政治研究中心。
潘兆民（2006.12）。兩岸地方民意機關職能的比較分析。論文發表於復旦大學選舉與人大制度研究中心成立儀式暨“監督法與人大監督的未來走向”學術研討會，上海復旦大學：上海復旦大學中國政府與政治研究中心。
潘兆民（2005.06）。法治教育與公民社會。論文發表於民主與法治教育研討會，明新科技大學：明新科技大學。
潘兆民（2004.01）。中國大陸鄉對村自治運作的影響分析。論文發表於第二屆中國地方治理學術研討會，廣州中山大學：廣州中山大學。
潘兆民（2003.11）。影響兩岸關係的變數分析。論文發表於國立中興大學兩岸關與東亞政治研討會，國立中興大學：國立中興大學。
潘兆民（2000.03）。人權教育政策的省思。論文發表於2000展望新紀元國際學術研討會，銘傳大學：銘傳大學。
潘兆民（1998.04）。兩岸關係發展的政治因素分析。論文發表於第七屆海峽兩岸關係學術研討會，北京：北京全國台灣研究會。
潘兆民（1997.03）。詭變中兩岸關係的新思維。論文發表於1997「邁向管理新紀元」國際學術研討會，台北：臺灣綜合研究院。
專書
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潘兆民*（2015.10）。中國大陸區域發展的轉型爭辯:政府、市場與公民社會。台北市大安區新生南路三段98巷1號1樓：結構群文化事業有限公司。（ISBN：9789869237703）
（2011.04）。中國漸進政治改革與鄉鎮人大治理。新北市永和區中正路522號6樓之2：結構群文化事業有限公司。（ISBN：978-957-28240-7-8）
（2009.10）。利益等待制度：中國地方人大的治理能力分析。台北：韋伯文化國際出版有限公司。（ISBN：9789866338090）
潘兆民*（2001.08）。社會科學導論。桃園：廣興書局。
潘兆民* 黃烈修（1999.05）。中國政治社會（譯著）。台北：韋伯文化事業出版社。（ISBN：957982066X）
潘兆民*（1996.01）。不平等的發展。台北：結構群出版社。
潘兆民*（1996.01）。中共社會主義現代化。台北：結構群出版社。
專書部份章節
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李樑堅、潘兆民、黃宬馨、侯長坤、李正言、陳守仁、柳金財、劉性仁、張雅屏、陳明德、蘇嘉宏、衛芷言、何慧俐、黃清賢（2025.11）。兩岸關係、疑美論與台灣風險。載於2（主編），兩岸關係新時代的動盪與和平（12-24頁）。新北市汐止區新台五路一段112號10樓A棟：博誌文化有限公司。（ISBN：978-986-210-200-8）
潘兆民（2024.11）。賴政府的兩岸關係走向:對立與融合。載於黃清賢（主編），兩岸關係新時代的衝擊與前景（91-102頁）。新北市中和區中山路二段362之5號9樓：大揚出版社。（ISBN：9786269862993）
潘兆民*（2023.11）。兩岸和平對話跳脫「安全困境」:以ECFA為例。載於黃清賢、陳明德、何慧俐（主編），兩岸關係新時代的形勢與發展（29-40頁）。新北市：大揚出版社。（ISBN：9786269762248）
潘兆民*（2022.11）。台灣的自由民主---不是只有選票而已。載於洪泉湖（主編），台灣的抉擇3---人民有權?政府有能?（63-81頁）。台北市新店區安德街71巷24號6樓之1：史記文化事業有限公司。（ISBN：9789860644715）
潘兆民*（2022.10）。兩岸關係困境中如何強化良性互動:新時代的九二共識。載於黃清賢、陳明德、何慧俐（主編），兩岸關係新時代的風險與前瞻（93-104頁）。新北市中和區中山路二段362-5號9樓：大揚出版社。（ISBN：9789575999797）
洪泉湖、周惠民、黃如惠、李炳南、潘兆民、蘇信宇、李明軒、林炫向、吳昆財、區桂芝、周世雄、陳顯武、鄭旗生（2021.04）。被撕裂的台灣:社會與政治/潘兆民。載於洪泉湖（主編），台灣的決擇2---孫中山思想與新古典社會主義（51-66頁）。台北市中正區羅斯福路二段14號2樓：史記文化事業有限公司。（ISBN：9789860644708）
潘兆民*（2017.07）。兩岸命運共同體的價值形塑：合作文化的建構。載於李義虎（主編），中華文化論壇論文集2016（113-125頁）。香港：中國評論學術出版社。（ISBN：978-988-8464-32-6）